Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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