Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan11Q9D1D1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms