Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms