Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms