Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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