Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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