Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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