Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms