Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms