Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms