Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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