Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim26Q99PN3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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