Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dok4Q99KE3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dok4Q99KE3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms