Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SmagpQ99KC7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms