Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smim11aQ99J19 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smim11aQ99J19 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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