Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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