Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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