Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Impg1Q8R1W8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Impg1Q8R1W8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms