Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf13Q8K2W6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms