Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms