Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms