Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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