Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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