Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms