Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ssc5dQ8BV57 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssc5dQ8BV57 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms