Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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