Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Frmd3Q8BHD4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Frmd3Q8BHD4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms