Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf8Q80TJ7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf8Q80TJ7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms