Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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