Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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