Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms