Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6DFW0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6DFW0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms