Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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