Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms