Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf1Q61069 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usf1Q61069 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf1Q61069 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms