Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms