Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Mkrn3Q60764 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Mkrn3Q60764 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mkrn3Q60764 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms