Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms