Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc85aQ5SP85 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc85aQ5SP85 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc85aQ5SP85 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc85aQ5SP85 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc85aQ5SP85 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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