Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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