Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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