Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms