Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms