Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrc1Q3UPH1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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