Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp30Q3UN04 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp30Q3UN04 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp30Q3UN04 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp30Q3UN04 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp30Q3UN04 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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