Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms