Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms