Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Q3U6N9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Q3U6N9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Q3U6N9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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