Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms