Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam107bQ3TGF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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